प्रोटीन की कमी ज्यादातर उन लोगों में होती है, जिन्हें पर्याप्त मात्रा में आहार नहीं मिल पाता है। इसके अलावा बुजुर्ग लोगों और कैंसर से पीड़ित लोगों को जरूरत के अनुसार प्रोटीन खाने में परेशानी हो सकती है। प्रोटीन की कमी से होने वाले गंभीर कुपोषण को क्वाशिओरकोर कहते हैं। विकासशील देशों में यह अधिक आम है, खासकर बच्चों में।