इंट्रावेनस एंटीबायोटिक दवाओं को आमतौर पर 7 से 10 दिनों के लिए देना होता है। यदि सेप्सिस किसी वायरस के कारण हुआ है, तो एंटीबायोटिक काम नहीं करेंगे। फिर भी, एंटीबायोटिक दवाएँ दी जा सकती हैं। ऐसा इसलिए किया जाता है कि इस बिमारी के लिए सटीक निदान नहीं मिलने तक एंटीबायोटिक उपचार में देरी करना बहुत खतरनाक होता है।