मुंह के छाले कभी-कभी कुछ चिकित्सीय स्थितियों के कारण हो सकते हैं, जैसे: वायरल संक्रमण - जिसमें कोल्ड सोर वायरस, चिकनपॉक्स और हाथ, पैर और मुंह की बीमारी शामिल है। विटामिन बी 12 या आयरन की कमी। क्रोहन रोग- एक दीर्घकालिक स्थिति जो पाचन तंत्र के अस्तर की सूजन का कारण बनती है।