टॉन्सिलिटिस के अधिकांश मामले एक सामान्य वायरस के संक्रमण के कारण होते हैं, लेकिन बैक्टीरिया के संक्रमण से भी टॉन्सिलिटिस हो सकता है। आमतौर पर टॉन्सिलाइटिस स्ट्रेप्टोकोकल बैक्टीरिया (streptococcal bacteria) के कारण होता है, जो कि स्ट्रेप थ्रोट (एक जीवाणु संक्रमण जिसके कारण गले में सूजन और दर्द होता है) का कारण बनता है। टॉन्सिल की तह में बायोफिल्म के कारण क्रोनिक और बार-बार होने वाला टॉन्सिलाइटिस हो सकता है । बायोफिल्म्स सूक्ष्मजीवों के समुदाय हैं जिन्होंने एंटीबायोटिक प्रतिरोध विकसित किया है, और वे बार-बार संक्रमण का कारण बन सकते हैं। बार-बार होने वाले टॉन्सिलाइटिस का एक कारण जेनेटिक्स भी हो सकता है।