आपको इस खुराक के सेवन के बाद पर्याप्त आराम करने की सलाह दी जाती है क्योंकि इससे पेट में गंभीर दर्द या योनि से ब्लीडिंग हो सकती है जिससे गर्भपात हो सकता है. इस दवा के सबसे सामान्य साइड इफेक्ट में मिचली आना , उल्टी, डायरिया (दस्त) और पेट में मरोड़े आना शामिल हैं.
मिसोप्रोस्टोल का उपयोग करने के बाद आपको ऐंठन और रक्तस्राव होगा। कुछ महिलाओं (सभी नहीं) के शरीर से रक्त के थक्के भी बाहर निकलते हैं। यह ठीक से जानना संभव नहीं है कि दर्द और रक्तस्राव कब शुरू होगा, लेकिन अक्सर यह मिसोप्रोस्टोल की पहली 4 गोलियों के उपयोग के बाद पहले 24 घंटो के अंदर या कुछ अधिक घंटो बाद भी हो सकता है।