आंखों के माइग्रेन की मुख्य वजह आंखों से जुड़ी धमनियों में रक्त के प्रवाह की कमी मानी जाती है. रेटिना में या आंख के पीछे रक्त वाहिकाओं में ऐंठन के कारण भी आई माइग्रेन की समस्या हो सकती है. हालांकि किसी भी स्थिति में दृष्टि का स्थायी नुकसान लगभग कभी नहीं होता है. न्यूरोलजिकल समस्याएं भी आई माइग्रेन की वजह हो सकती हैं.