लेजर मोतियाबिंद सर्जरी की लागत पारंपरिक फेको प्रक्रिया की तुलना में बहुत अधिक है क्योंकि फेमटोसेकंड लेजर मशीन और इसके रखरखाव की लागत बहुत अधिक है। ऐसी कुछ स्थितियाँ हैं जिनमें लेजर की सहायता से मोतियाबिंद की सर्जरी नहीं की जा सकती है जैसे छोटी पुतली और कॉर्नियल निशान आदि।