एचपीवी संक्रमित व्यक्ति में कई वर्षों तक सुप्त अवस्था में मौजूद रह सकता है, इस दौरान इसमें कोई लक्षण नहीं दिखाई देता और व्यक्ति स्पर्शोन्मुख रहता है। वायरस संख्या में गुणा कर सकता है, फिर भी लक्षणों के बिना शेष रह सकता है।