दिमागी बुखार यानि इंसेफेलाइटिस दो प्रकार के होते हैं। प्राथमिक (प्राइमरी) और माध्यमिक (सेकेंडरी)। दिमागी बुखार के प्राथमिक स्तर में वायरस मस्तिष्क और रीढ़ की हड्डी पर संक्रमित करता है, जबकि दिमागी बुखार की दूसरी स्थिति में इंफेक्शन शरीर के अन्य अंगो से होते हुए मस्तिष्क तक पहुंचता है।