एंकाइलोज़िंग स्पॉन्डिलाइटिस के अधिकतर रोगियों में HLA B27 पॉजिटिव होता है । पर कुछ मरीज़ों में HLAB27 नेगेटिव हो सकता है। हालाँकि, ऐसे अन्य कईं जीन हैं जो एंकाइलोज़िंग स्पॉन्डिलाइटिस के मरीज़ों में मिल सकते हैं। यह आवश्यक नहीं की एंकाइलोज़िंग स्पॉन्डिलाइटिस के मरीज़ में HLAB27 हमेशा सकारात्मक हो।