अधिकतर फंक्शनल सिस्ट का आकार 2-5 सेमी होता है। ओव्यूलेशन तब होता है जब इन सिस्ट का आकार लगभग 2-3 सेमी होता है। हालांकि, कुछ सिस्ट का आकार 8-12 सेमी तक भी हो सकता है।