हालांकि पेट के अल्सर आसानी से ठीक हो सकते हैं, लेकिन उचित उपचार के बिना वे गंभीर हो सकते हैं। वैसे तो डॉक्टर पेप्टिक अल्सर में 10 दिन की दवा देते हैं। इसमें खासतौर से पीपीआई (प्रोटॉन पंप इनहिबिटर), क्लैरीथ्रोमाइसिन और एमॉक्सिस्लिन ग्रुप की दवाएं होती हैं। इनसे एसिड का असर कम हो जाता है।